Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX7O95931 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX7O95931 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX7O95931 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX7O95931 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX7O95931 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX7O95931 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX7O95931 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX7O95931 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX7O95931 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms