Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD1O95696 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD1O95696 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD1O95696 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD1O95696 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD1O95696 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD1O95696 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD1O95696 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD1O95696 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD1O95696 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD1O95696 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD1O95696 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD1O95696 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD1O95696 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD1O95696 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD1O95696 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD1O95696 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD1O95696 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD1O95696 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD1O95696 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD1O95696 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD1O95696 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRD1O95696 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRD1O95696 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD1O95696 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms