Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms