Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR4O95473 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms