Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOO75962 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOO75962 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOO75962 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOO75962 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOO75962 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOO75962 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOO75962 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOO75962 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIOO75962 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIOO75962 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIOO75962 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIOO75962 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms