Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN15O75808 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms