Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms