Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRCH4O75427 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH4O75427 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms