Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX3O75364 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX3O75364 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX3O75364 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX3O75364 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX3O75364 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX3O75364 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX3O75364 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX3O75364 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX3O75364 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX3O75364 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX3O75364 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX3O75364 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX3O75364 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX3O75364 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX3O75364 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms