Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILPO75339 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILPO75339 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILPO75339 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILPO75339 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILPO75339 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILPO75339 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILPO75339 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CILPO75339 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILPO75339 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILPO75339 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CILPO75339 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CILPO75339 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILPO75339 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CILPO75339 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CILPO75339 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CILPO75339 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CILPO75339 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CILPO75339 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CILPO75339 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CILPO75339 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CILPO75339 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CILPO75339 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CILPO75339 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CILPO75339 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms