Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBNO60934 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBNO60934 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBNO60934 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NBNO60934 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBNO60934 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBNO60934 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBNO60934 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBNO60934 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBNO60934 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBNO60934 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBNO60934 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBNO60934 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBNO60934 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBNO60934 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBNO60934 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBNO60934 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBNO60934 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBNO60934 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBNO60934 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBNO60934 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBNO60934 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBNO60934 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBNO60934 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBNO60934 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBNO60934 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NBNO60934 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBNO60934 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NBNO60934 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBNO60934 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBNO60934 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBNO60934 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms