Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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