Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP104O60308 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP104O60308 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP104O60308 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP104O60308 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP104O60308 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP104O60308 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP104O60308 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP104O60308 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP104O60308 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP104O60308 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP104O60308 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP104O60308 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP104O60308 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP104O60308 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP104O60308 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP104O60308 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP104O60308 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP104O60308 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP104O60308 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP104O60308 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP104O60308 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP104O60308 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP104O60308 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms