Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CREB3O43889 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3O43889 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3O43889 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3O43889 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3O43889 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3O43889 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3O43889 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3O43889 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3O43889 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3O43889 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3O43889 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3O43889 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3O43889 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3O43889 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3O43889 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3O43889 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3O43889 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms