Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR2O43760 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms