Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX6O43752 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX6O43752 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX6O43752 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX6O43752 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX6O43752 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STX6O43752 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX6O43752 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STX6O43752 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX6O43752 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX6O43752 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX6O43752 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX6O43752 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX6O43752 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX6O43752 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX6O43752 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms