Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms