Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms