Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA2O43464 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms