Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI1O43347 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI1O43347 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MSI1O43347 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI1O43347 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI1O43347 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI1O43347 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI1O43347 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms