Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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