Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPINT1O43278 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPINT1O43278 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINT1O43278 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINT1O43278 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPINT1O43278 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINT1O43278 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPINT1O43278 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPINT1O43278 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINT1O43278 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPINT1O43278 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINT1O43278 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINT1O43278 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINT1O43278 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms