Protein–RNA interactions for Protein: O15173

PGRMC2, Membrane-associated progesterone receptor component 2, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2O15173 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PGRMC2O15173 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGRMC2O15173 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms