Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A1O14983 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A1O14983 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A1O14983 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A1O14983 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms