Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRTO14522 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
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