Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXLO00592 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXLO00592 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXLO00592 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXLO00592 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXLO00592 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXLO00592 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXLO00592 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXLO00592 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PODXLO00592 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PODXLO00592 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PODXLO00592 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PODXLO00592 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PODXLO00592 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PODXLO00592 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PODXLO00592 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PODXLO00592 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PODXLO00592 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms