Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM1O00562 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms