Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELL2O00472 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELL2O00472 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELL2O00472 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELL2O00472 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELL2O00472 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELL2O00472 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELL2O00472 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELL2O00472 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ELL2O00472 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ELL2O00472 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELL2O00472 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ELL2O00472 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ELL2O00472 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELL2O00472 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ELL2O00472 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ELL2O00472 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ELL2O00472 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ELL2O00472 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ELL2O00472 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ELL2O00472 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ELL2O00472 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms