Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10AO00220 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms