Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3KR12 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3KR12 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
J3KR12 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3KR12 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3KR12 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3KR12 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms