Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
I3L4J1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
I3L4J1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
I3L4J1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
I3L4J1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
I3L4J1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
I3L4J1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
I3L4J1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
I3L4J1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
I3L4J1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
I3L4J1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
I3L4J1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
I3L4J1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
I3L4J1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
I3L4J1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
I3L4J1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
I3L4J1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms