Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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