Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9IYK1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9IYK1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9IYK1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9IYK1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9IYK1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9IYK1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9IYK1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9IYK1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9IYK1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9IYK1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms