Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms