Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8JA6NMD2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8JA6NMD2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms