Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms