Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HELTA6NFD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms