Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NDN8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NDN8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NDN8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NDN8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A6NDN8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
A6NDN8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NDN8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NDN8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NDN8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NDN8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NDN8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms