Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPDC1A2A3K4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms