Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1C5

CYP2D7, Putative cytochrome P450 2D7, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2D7A0A087X1C5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2D7A0A087X1C5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms