Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 POTEH-203ENST00000621704 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 C10orf53-204ENST00000535836 2090 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 TMX3-201ENST00000299608 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 NLRP12-205ENST00000391775 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 SYT17-202ENST00000562034 5092 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AL078604.2-201ENST00000430078 2002 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC099792.1-202ENST00000635290 2012 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 EFHB-201ENST00000295824 2823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 C2CD5-201ENST00000333957 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CTNNBL1-210ENST00000628103 1958 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 BAP1-201ENST00000296288 3434 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC005618.2-201ENST00000618012 2297 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 CAPZA1-201ENST00000263168 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 PSMD2-206ENST00000439383 2633 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 GRAMD1B-206ENST00000529432 6266 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 ZNF195-215ENST00000526601 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC026461.4-201ENST00000379816 242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 TRAV38-2DV8-201ENST00000390465 395 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC009404.1-202ENST00000439955 968 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 GNGT2-202ENST00000503070 522 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 TIMM10B-203ENST00000530751 809 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AL357093.2-201ENST00000555407 601 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 CD300LF-210ENST00000583937 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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RORCP51449 AD000671.1-201ENST00000591613 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AL627230.4-201ENST00000617851 370 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RORCP51449 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 GAD1-202ENST00000358196 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 MTERF4-202ENST00000391980 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RORCP51449 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 ANKRD18B-201ENST00000290943 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 MACF1-234ENST00000641012 4284 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 SLC24A4-201ENST00000393265 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 ZNF16-201ENST00000276816 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RORCP51449 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 TP53-224ENST00000619186 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 TMEM255A-203ENST00000371369 3425 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RORCP51449 PEX11A-201ENST00000300056 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 SEMA4G-202ENST00000370250 3596 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RORCP51449 ZNF800-202ENST00000393312 2375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 TCAIM-205ENST00000417237 1844 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 LINC00710-201ENST00000428520 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 EPHB1-211ENST00000493838 2786 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 AL596202.1-201ENST00000435295 3088 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 LRRFIP2-203ENST00000396428 1791 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC097662.1-201ENST00000439598 2568 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 TIMELESS-203ENST00000553532 5121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 FAM86B2-201ENST00000262365 1268 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RORCP51449 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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