Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCINQ9Y6U3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCINQ9Y6U3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms