Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDY1Q9Y6F8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms