Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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SNX13Q9Y5W8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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