Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP16Q9Y5T5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms