Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms