Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms