Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms