Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
THRAP3Q9Y2W1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms