Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG6Q9Y2V7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms